Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms