Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00869P0C866 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms