Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L7P0C7H9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms