Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB7P09629 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms