Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIL1P09327 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIL1P09327 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIL1P09327 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIL1P09327 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIL1P09327 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIL1P09327 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms