Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGPP08493 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MGPP08493 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MGPP08493 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MGPP08493 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms