Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms