Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALB1P05937 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALB1P05937 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALB1P05937 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALB1P05937 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALB1P05937 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALB1P05937 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALB1P05937 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms