Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA2P02652 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA2P02652 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOA2P02652 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA2P02652 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA2P02652 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA2P02652 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA2P02652 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA2P02652 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA2P02652 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms