Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOEP02649 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOEP02649 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOEP02649 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOEP02649 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOEP02649 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOEP02649 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOEP02649 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOEP02649 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOEP02649 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOEP02649 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOEP02649 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOEP02649 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms