Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNB1P01574 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms