Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RP00736 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RP00736 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1RP00736 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1RP00736 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1RP00736 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1RP00736 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RP00736 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1RP00736 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1RP00736 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms