Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX58O95786 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDX58O95786 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDX58O95786 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX58O95786 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX58O95786 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms