Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG7O95352 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG7O95352 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG7O95352 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG7O95352 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG7O95352 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG7O95352 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG7O95352 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG7O95352 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG7O95352 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG7O95352 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATG7O95352 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms