Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOBTB3O94955 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms