Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSDE1O75534 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms