Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBNO60934 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBNO60934 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBNO60934 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBNO60934 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBNO60934 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBNO60934 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBNO60934 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBNO60934 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBNO60934 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBNO60934 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBNO60934 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBNO60934 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms