Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV3LO60673 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV3LO60673 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REV3LO60673 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV3LO60673 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV3LO60673 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV3LO60673 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV3LO60673 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REV3LO60673 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV3LO60673 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV3LO60673 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV3LO60673 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV3LO60673 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms