Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPLO60437 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPLO60437 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPLO60437 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PPLO60437 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPLO60437 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PPLO60437 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPLO60437 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPLO60437 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPLO60437 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PPLO60437 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPLO60437 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms