Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX15O60248 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX15O60248 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX15O60248 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX15O60248 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX15O60248 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX15O60248 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms