Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYTH3O43739 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms