Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCXO43602 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCXO43602 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCXO43602 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCXO43602 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCXO43602 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCXO43602 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCXO43602 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCXO43602 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCXO43602 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCXO43602 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCXO43602 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms