Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FOXO3O43524 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FOXO3O43524 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXO3O43524 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXO3O43524 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms