Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SYNJ1O43426 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNJ1O43426 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms