Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MTSS1O43312 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTSS1O43312 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTSS1O43312 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTSS1O43312 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTSS1O43312 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTSS1O43312 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTSS1O43312 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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