Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRRTM2O43300 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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