Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP3O43295 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms