Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC11O43248 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC11O43248 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC11O43248 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC11O43248 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC11O43248 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms