Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHUKO15111 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHUKO15111 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHUKO15111 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHUKO15111 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHUKO15111 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHUKO15111 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHUKO15111 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHUKO15111 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHUKO15111 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHUKO15111 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHUKO15111 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms