Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLGNO14967 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLGNO14967 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLGNO14967 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLGNO14967 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLGNO14967 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLGNO14967 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLGNO14967 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLGNO14967 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms