Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AGRNO00468 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms