Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3C2AO00443 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms