Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP1O00294 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP1O00294 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TULP1O00294 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TULP1O00294 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms