Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PBE3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PBE3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PBE3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PBE3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E9PBE3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms