Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRDCB7Z8K6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms