Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BECN2A8MW95 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms