Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KNCNA6PVL3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms