Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L3A6NEY3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms