Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD3L3A6NE82 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms