Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L4A6NCW7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms