Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF222A6NCQ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF222A6NCQ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms