Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POTEFA5A3E0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms