Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA8A3KMH1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms