Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms