Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms