Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J269

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J269 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0B4J269 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms