Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
V9GY48 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
V9GY48 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
V9GY48 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
V9GY48 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
V9GY48 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
V9GY48 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
V9GY48 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
V9GY48 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
V9GY48 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
V9GY48 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
V9GY48 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
V9GY48 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
V9GY48 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
V9GY48 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
V9GY48 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
V9GY48 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms