Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP16Q9Y5T5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms