Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms