Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms